El 16 de septiembre convirtió su primer gol en la Champions League en una victoria ante el PSV como visitantes, también asegurando la clasificación del equipo a octavos de final. En mayo de 2006, Agüero se incorporó al club español Atlético de Madrid por una transferencia tasada alrededor de 20 millones de euros, rompiendo el récord de la transferencia más cara del club. El 30 de mayo fue oficializado el traspaso del 90 % de su pase al Atlético de Madrid, a cambio de 20 millones de euros, marcando un récord tanto para el fútbol Aguero Juegos argentino como para la entidad española.
Hasta el siglo XI ejerció dicho obispo su dominio espiritual sobre la parroquial, si bien la Iglesia de San Salvador en estos momentos el obispo aragonés García de Aragón comenzó a reivindicar estas zonas que antaño pertenecieron al obispado de Huesca. Eclesiásticamente, Agüero inició su historia incluida dentro del dominio de la diócesis de Pamplona, ya que desde fines del siglo X el obispo pamplonés poseía en este lugar sus bienes y patrimonio. La conquista de Agüero debió de ocurrir en 921, durante la conquista de «todas las montañas de Aragón y Sobrarbe» realizadas por Sancho Garcés I de Pamplona según menciona la Crónica de San Juan de la Peña e igualmente la población aparece mencionada a mediados del en el año 938 en los documentos del Monasterio de Leyre ya que este recibía las décimas de esta población así como de las de Castelmanco y otras poblaciones cercanas. La localidad, perteneciente a la comarca de la Hoya de Huesca, se encuentra asentada frente a los mallos, que son el límite entre la montaña pirenaica y el Somontano.
En la final contra Nigeria, recibió una falta en el área que Messi convirtió en gol, permitiendo la victoria y el título. Dos días después de la final de la Liga de Campeones, el Fútbol Club Barcelona confirmó oficialmente en sus redes sociales la incorporación de Agüero, sellando su retorno a la liga española después de 10 años en el fútbol inglés. El 13 de marzo, el Kun convirtió su primer gol en la Premier desde enero del 2020 en una victoria 3 a 0 ante Fulham. El 12 de enero del 2020, Agüero anotó su duocénimo triplete en su carrera en la Premier League ante el Aston Villa en una victoria 6 a 1 en Villa Park, superando la marca de 175 goles de Henry. El 19 de agosto, anotó su noveno triplete en la Premier League al Huddersfield Town, poniendolo solo a dos del récord de Alan Shearer de 11. Más tarde fue premiado con el Jugador del Mes por enero, ganando el premio por quinta vez en su carrera.
De los 38 partidos de la temporada solo estuvo ausente en dos, en ambos casos por suspensión, y marcó un total de 18 goles. Daniel Bertoni le dio cierto espacio como suplente, pero fue Pedro Monzón quien le confió la titularidad en los únicos tres partidos de su corto ciclo al frente de la institución, al cierre del Apertura 2004. A pesar de su temprano debut, Agüero no volvió a ser tenido en cuenta por Ruggeri ni por su reemplazante Osvaldo Sosa en lo que restaba de ese año.
Desde noviembre de 2022, forma parte de la nueva liga de fútbol 7 creada por Gerard Piqué llamada Kings League, donde están involucrados varios streamers hispanohablantes como Ibai Llanos, Juansguarnizo y DjMariio entre otros, y algunos exfutbolistas como Iker Casillas y el propio Agüero. Y nuevamente el 1 de noviembre de 2011 la FIFA y la revista France Football anunciaron que Agüero era uno de los 23 jugadores candidatos a obtener el FIFA Balón de Oro 2011. Posteriormente disputó los amistosos frente a España (2006), Francia y Australia (2007), ingresando como suplente y sin anotar. En Países Bajos, siendo el más joven de la campaña (un año menor que Lionel Messi, el siguiente en la lista), tuvo una participación secundaria.
- El 13 de marzo, el Kun convirtió su primer gol en la Premier desde enero del 2020 en una victoria 3 a 0 ante Fulham.
- Es el segundo de los siete hijos de una familia humilde originaria de Tucumán, para cuyo bienestar económico su prominente carrera significó una gran ayuda.
- El día de la Invención de la Santa Cruz, que se celebra el 3 de mayo.
- En Países Bajos, siendo el más joven de la campaña (un año menor que Lionel Messi, el siguiente en la lista), tuvo una participación secundaria.
- También fue premiado de nuevo como el Jugador del Mes de la Premier League por noviembre del 2014, un mes donde anotó tres goles y asistió en otros dos.
El Manchester City Football Club anunció el 23 de agosto de 2021 que Agüero tendría una estatua en el Etihad Stadium para conmemorar su trayectoria en el club, en el cual se convirtió en uno de sus ídolos como máximo goleador de su historia. Sergio disputó los siete partidos como titular, convirtiendo seis goles y mostrando un gran nivel, lo que le mereció el galardón del Balón de Oro y Bota de Oro (mejor jugador y goleador respectivamente) y se convirtió en el tercer jugador de la historia en obtener dos títulos sub-20. En enero, anotó su segundo triplete de la temporada al Newcastle, instaurando la marca de su gol 350 durante su carrera. El 24 de mayo, durante el último partido de la temporada del City ante el Southampton, Agüero anotó su gol número 26 en la Premier League, ganando la Bota de Oro de la temporada por primera vez en su carrera. Debutó oficialmente el 15 de agosto en una victoria 4 a 0 contra el Swansea, donde entró como suplente en el minuto 59, y metió su primer gol solo nueve minutos después de su ingreso, luego de empujarla tras un centro raso del lateral Mikah Richards.
Agüero anotó su segunda oportunidad para acabar ganando 5 a 0 el partido y empezar la defensa por el título del City. El 10 de agosto Agüero entró como suplente de Gabriel Jesús, en un partido que fue dominado por la introducción del VAR, en el London Stadium del West Ham. El 21 de septiembre, el club anunció que Agüero firmó un nuevo contrato que lo mantendría en el Etihad Stadium hasta 2021. Sin embargo, la temporada no acabaría superando las expectativas, al perder la liga ante el Chelsea y quedar eliminado de la Champions ante el Mónaco en octavos de final. El 10 de febrero, le anotó cuatro goles al Leicester City en su tercer triplete en la temporada. Esta victoria también alargó la racha de 11 victorias seguidas del City, otro récord del club.
En marzo de 2009, Forlán y el Kun anotaron ambos un doblete para derrotar a los líderes de La Liga, el Barcelona, con este último anotando el gol ganador sobre el último minuto. Acabó su primera temporada en España con solo 7 goles en todas las competencias, con el entrenador Javier Aguirre optando por haciendólo un cambio frecuente en los partidos para adaptarlo al fútbol europeo. A pesar de su poco tiempo en España, causó mucha controversia cuando anotó un gol con la mano ante Recreativo Huelva para ganar el partido en octubre del 2006. Sin embargo, y debido precisamente tanto a que no estaba descartado de la convocatoria mayor como por su posible venta, fue descartado de esta selección juvenil. También lo son los dos goles (sobre todo el segundo) convertidos en el Clausura 2006, y que significaron la victoria frente al vecino rival. Fue también en esta temporada en la que Agüero recibió su primera y única expulsión en Argentina.
También fue premiado de nuevo como el Jugador del Mes de la Premier League por noviembre del 2014, un mes donde anotó tres goles y asistió en otros dos. Esto hizo que el Kun llegara a 61 goles por Premier League con los Citizens, superando a su compatriota Carlos Tévez por el récord como el máximo goleador de la competencia en el club. El 18 de octubre de 2014, anotó los cuatro goles de la victoria 4 a 1 ante el Tottenham, dos de los cuales fueron penales; tuvo otra chance de penal, pero fue atajado por Hugo Lloris. Para el 21 de abril, anotó su primer gol desde enero, en una derrota ante el WBA en el Etihad Stadium. El 2 de marzo de 2014, regresó tras una lesión para la final de la League Cup ante el Sunderland en la victoria del City por 3 a 2 en Wembley, siendo el segundo título del Kun con los citizens.
Historia
El 11 de septiembre del 2005, Agüero hizo un gol memorable frente al clásico rival, Racing Club, tras eludir a un defensor y enganchar varias veces, cerrando la goleada por 4-0 a favor del Rojo. El 19 de junio en Rafaela, por el Torneo Clausura 2004, obtuvo por primera vez la titularidad y permaneció en el campo los 90 minutos. Siete minutos después de entrar, Kun (así le dicen en el club) metió un lindo enganche y pasó con velocidad al ataque.
Este gol también fue el sexto hacía el Newcastle en la temporada, haciéndolo el sexto jugador durante la era de la Premier League en anotarle seis goles al mismo club durante la misma campaña. En abril de 2016, le anotó un triplete al Chelsea en Stamford Bridge, convirtiéndose en el tercer jugador visitante en anotar esta cantidad de goles por Premier League en ese estadio, y el quinto jugador en lograr tres temporadas seguidas con 20 goles. El 8 de octubre, durante un partido por las Eliminatorias para el Mundial 2018 ante Ecuador, Agüero fue sacado del partido por una nueva lesión del tendón, con el delantero saliendo en lágrimas. El 3 de octubre, anotó cinco goles contra el Newcastle para remontar una victoria por 6 a 1, una marca que solo habían conseguido Andy Cole, Alan Shearer, Jermain Defoe y Dimitar Berbatov en un juego de Premier League. Superó los 30 goles de la temporada luego de anotarle un triplete al Queens Park Rangers por Premier League en una victoria 6 a 0 que sepultó al descenso a los rivales. El 21 de febrero de 2015, anotó el gol de penal más rápido de la historia de la Premier League desde 1994, al convertirle un penal al Newcastle con solo 72 segundos en juego.
Superó el récord con su gol 178 en una victoria 4-2 ante el Napoli que hizo que el equipo avance para la fase eliminatoria de la Champions League. El 21 de octubre, Agüero anotó su gol 177 para el Manchester City en una victoria 3-0 al Burnley, igualando el récord de Eric Brook. Cuatro minutos después de marcar su quinto gol, Agüero fue reemplazado del partido por el entrenador Manuel Pellegrini, a lo que el delantero argentino se mostró molesto por la decisión. Sus cinco goles en 23 minutos de juego lo hicieron la forma más rápida en llegar a la marca desde la aparición de la Premier League en 1992.